Autores: Chaves Diego, Sandoval Andrea, Rodríguez Luis, García Juan C, Restrepo Silvia, Zambrano María Mercedes
Introducción. El creciente número de genomas secuenciados pertenecientes al complejo Mycobacterium tuberculosis hace posible la comparación y el análisis genómico, que puede revelar importantes mecanismos de evolución y variación para entender la patogénesis de esta especie. Objetivo: Mediante el uso de alineamientos múltiples se pretendió analizar las diferencias entre seis genomas del complejo M. tuberculosis, para encontrar regiones de variación que conduzcan a mejoras en la identificación de estas especies o en el tratamiento. Materiales y métodos: Mediante el programa bioinformático Mauve, se realizaron alineamientos múltiples de seis genomas pertenecientes a especies del complejo M. tuberculosis. Las regiones genómicas exclusivas para cada genoma se anotaron usando la base de datos Tuberculosis Database. Resultados: El porcentaje de similitud entre los seis genomas analizados estuvo entre 96.1% y 97.8%. La anotación de las regiones exclusivas reveló la presencia de elementos de transposición, familias de proteínas PPE y PE-PGRS, regiones asociadas a resistencia contra bacteriófagos y regiones intergénicas. Conclusiones: A pesar de la gran similitud entre las cepas analizadas, existen variaciones entre ellas que pueden ser importantes para entender diferencias en comportamiento y virulencia, así como para mejorar los diagnósticos de cepas específicas. Regiones como aquéllas con genes para proteínas de membrana, posiblemente, relacionadas con la variación y la respuesta antigénica, son de particular interés para estudios futuros orientados a buscar tratamientos nuevos para el control de esta enfermedad
Palabras clave: Mycobacterium tuberculosis genómica tuberculosis.
2010-06-29 | 1,628 visitas | Evalua este artículo 0 valoraciones
Vol. 30 Núm.1. Enero-Marzo 2010 Pags. 23-31 Biomédica 2010; 30(1)